對于運用論文查重軟件，各高校都制定了一套相應的查重要求和處理辦法。一般以論文的文字總重復率規(guī)定的標準各不相同，將查重結果大致分為:查重通過，修改后重新查重，查重不通過等情況，并提出相應的處理辦法。但這寫措施只能治標，治本需要從源頭治理。

不可太過依賴查重系統(tǒng)來做最終判斷。這不僅對學術不端行為不能起到真正有效的遏制作用，反而會誤導導師或研究生，使他們不重視論文的學術水平，而專注于如何降低文字重復率，從而對論文文字部分進行隨意刪減或調(diào)整，反而可能降低論文質量。因此，應加強論文查重軟件的宣傳和培訓，要求導師和研究生重視論文的學術水平。

查重系統(tǒng)關鍵環(huán)節(jié)之一是查重者。查重者不僅可以是研究生管理部門的工作人員，還可以分到各個學院，由各學院指定專人負責，這樣既可以加大查重力度，又可以提高查重效率。由于查重者難免會受到一些干擾，因此，要求查重者能認真、負責地開展這些工作。而且可以增加人員協(xié)助查重，以提高查重工作效率。同時可以邀請導師、研究生或管理人員到場協(xié)同監(jiān)督，這樣有助于查重者排出干擾，公平公正地順利開展論文查重。

論文完成初稿，選擇在這個時機進行查重，可以進一步保證論文的送審質量。但僅這一次查重還不一定能達到真正目的，因此可以采取分段進行查重。除了在論文送審前，還可以選擇在論文答辯前或論文答辯后進行查重。但最佳查重時機是在論文答辯后，定稿提交論文的時候，因為此時論文已經(jīng)定稿，進行論文查重更能反映出論文的真實情況。但此時各高校忙于研究生畢業(yè)，因此如何處理好時間緊迫、人員不足、處理要快等矛盾關系，需要我們因地制宜，認真考慮和合理安排。

總之，學術不端行為應該堅決遏制，加大對每年的學生論文的論文查重力度。